Para nosotros como estudiantes de química, es de mucha importancia el conocer programas que estén relacionados a lo que estudiamos, pues nos son de mucha ayuda en nuestras clases o nos serán en las siguientes, e incluso en el ámbito laboral. Sin embargo, en las clases es algo que no se observa mucho, pues generalmente solo vemos teoría y en laboratorio las practicas y lo relacionamos con lo que se conoce teóricamente. Pero, muchas de las veces, generalmente en laboratorio, no nos quedan claro muchas cosas, por ejemplo, como es que ocurre la transformación de los reactivos en productos, que intermediarios existen, como se modifican las moléculas, etc.
Para ello existen muchos programas como los son los siguientes, que son parte de Linux;
*Avogadro: Es un editor y visualizador de moleculas para la bioinformatica, quimica computacional, modelado molecular, etc.
*Chimera: Es un programa para la interaccion y el analisis de estructuras moleculares y datos relacionados a ello, incluye mapas de densidad, secuencia de alineaciones, imagenes e incluso animaciones.
*Jmol: Es un visor de Java de codigo abierto, para observar estructuras quimicas en 3D.
*MacMolPlt: Para estructuras moleculares.
*MOPLOT: Visualizacion de moleculas, propiedades y orbitales.
*RasMol: Para la visualizacion de proteinas, acidos nucleicos y moleculas pequeñas.
*WHAT IF: Modelado macromolecular, analisis de estructuras proteicas que pueden ser usados para predecir mutaciones o verificaciones de estructuras.
Bibliografia:
http://www.relaq.mx/RLQ/graficas_moleculares.html
